O MHN, xestionado pola Sociedade Galega de Historia Natural -unha entidade científica e conservacionista sen ánimo de lucro- en convenio co Concello de Ferrol, é un museo singular en España.

Os seus fondos proceden das actividades da entidade e de doazóns de coleccións particulares, sempre baixo o principio de non danar á Natureza. Destaca a probablemente mellor colección de ósos de cetáceos ibérica, na que destaca o esqueleto dunha balea común de 18 m., e dermoplastias de cetáceos, focas e tartarugas mariñas. Unha lura xigante e raras especies de quenllas en líquidos conservantes son pezas moi raras, como os fósiles de Zifios de 15 millóns de anos de antigüidade, dos que o museo alberga holotipos únicos. Unha completa colección de moluscos de Filipinas do s.XIX, comparte espazo cunha mostra de herbarios e algarios, seccións de árbores procedentes de parques históricos, insectos, moluscos e crustáceos de Galicia, preparacións de aves e mamíferos atopados no medio e un apartado dedicado á caza de baleas.

Moi recomendable para visitas familiares e centros escolares polo seu enfoque didáctico.